Pelajar SMA yang konservatif di bidang energi, Houtarou Oreki, berakhir dengan lebih dari apa yang dia tawar ketika dia mendaftar ke Klub Klasik atas perintah adiknya — terutama ketika dia menyadari betapa berakarnya sejarah klub itu. Begrudgingly, Oreki diseret ke dalam penyelidikan mengenai misteri berusia 45 tahun yang mengelilingi ruang klub. Ditemani oleh anggota klubnya, Satoshi Fukube yang berpengetahuan, Mayaka Ibara yang tegas namun jinak, dan Eru Chitanda yang selalu ingin tahu, Oreki harus memerangi tenggat waktu dan kurangnya informasi dengan akal dan bakat tersembunyi, agar tidak hanya menemukan kebenaran yang terkubur di bawah debu karya yang diciptakan bertahun-tahun sebelum mereka, tetapi dari kasus sampingan kecil lainnya juga. Berdasarkan Koten-bu pemenang penghargaan seri novel ringan, dan disutradarai oleh Yasuhiro Takemoto dari Suzumiya Haruhi no Shoushitsu, Hyouka menunjukkan bahwa kehidupan normal bisa penuh dengan misteri kecil, baik itu sejarah keluarga, film siswa, atau bahkan bunga layu yang membentuk cerita hantu.